工件在清洗槽內的擺放方式與清洗質量有很大的關系，它的擺放方式又與工件的大小、形狀、結構有關。一般來說，工件之間的重疊堆放，或一次堆放過多都會影響清洗效果。

釹鐵硼磁性材料雖然形狀各異，但多屬于小型零件。可以將它放在尼龍網上，在清洗槽內進行晃動清洗，這樣有助于工件表面的污物脫落，也有利于帶有盲孔工件的水膜破壞，使盲孔內易產生空化效應。另一種擺放方式是直接將工件攤平在清洗槽底板(也就是超聲波換能器輻射板)上，使工件承受強烈的超聲波沖擊。實踐證明這種直接將工件放在底板上進行清洗的方法，清洗效果最佳，效率最高。